Un industrial japonez, sub influența modei americane, a decis să înceapă construirea de adăposturi atomice individuale, dar nu au putut stabili producția în masă, iar singurul adăpost construit a fost abandonat. Cinci ani mai târziu, compania de construcții, folosind buncărul ca fundație, a ridicat o clădire cu trei etaje, în spatele căreia era învecinată versantul. În această casă s-a instalat un bărbat care a părăsit voluntar societatea. În trecutul recent, a fost secretarul personal al unui politician celebru, s-a căsătorit cu fiica sa și a făcut reclamă la adăposturi atomice într-o companie de construcții pe care socrul său o controla.
Dar, într-o bună zi, a luat de la soția sa un fiu în vârstă de cinci ani, pe care medicii îl considerau retardat mental, și a început să locuiască cu copilul ca recuzabil într-un adăpost. El însuși s-a numit avocatul celor pe care îi iubea cel mai mult în această lume - copaci și balene. Și-a schimbat numele pentru a sublinia noua sa esență și a început să se numească Ooki („copac puternic”) Isana („pește curajos”). El este angajat să se uite la fotografiile cu balenele, urmărind prin binoclu copacii care cresc afară. Pentru a fi mai aproape de natură, a făcut o gaură în podeaua buncarului 30 × 30 de centimetri și s-a scufundat în gândire, punându-și picioarele goale pe pământ real. Isana a atins vocile diferitelor păsări, iar fiul său Dzin a învățat să le recunoască cu exactitate: s-a dovedit că băiatul are un auz neobișnuit de tare.
Odată ce un incident are loc într-o zonă joasă, mlăștinoasă, care este vizibilă de la ferestrele unui adăpost. O fată tânără seduce un agent de poliție, iar prietenii ei îl atacă și iau o armă. Pentru a se salva, agentul îl selectează pe cel mai slab dintre atacatori și, după ce s-a confruntat, îi pune o cătușă pe mână, în timp ce face clic pe a doua cătușă pe mână. Adolescenții l-au bătut pe agent, iar băiatul încearcă să-i taie mâna pentru a scăpa. Un agent de poliție desfășoară cătușa și fuge, iar adolescenții urlă după el mult timp.
Văzând că copacii erau acoperiți de frunze tinere și căpătau un sentiment de siguranță completă, Isana, conectată spiritual cu ei, se simte protejată și părăsește adăpostul. El, la fel ca plantele, se trezește din hibernare și caută o cale de ieșire pentru energia acumulată în el. Împreună cu Jin, se urcă în autobuz și merge în parc, dar ajung prea târziu: parcul este deja închis, iar plimbările nu funcționează. Păzitorul le lipsește totuși, iar într-un parc pustiu întâlnesc un grup de adolescenți agresivi, dintre care unul are o mână bandajată. Isana simte o teamă de necontestat și se grăbește să se întoarcă la adăpost. Mergând la magazin și lăsând-o pe Jin acasă singură, Isana trăiește și frică. Are coșmaruri noaptea. El are senzația că adăpostul lor este urmărit tot timpul. Odată descoperă un desen pe peretele unei case - un cerc și o cruce. Isana pictează lângă acest model de ochi. Întâlnește o fată în apropierea casei sale, care îi oferă să doarmă în dressingul celebrei actrițe într-un studio de film abandonat, stând puțin mai departe de terenurile mlăștinoase. Isana nu răspunde nimic și pleacă, iar noaptea aude călcarea adolescenților pe acoperiș și se îngrijorează de Jin, al cărui echilibru mental fragil este atât de ușor supărat.
A doua zi, Isana privește binoclul spre ruinele unui studio de film și vede o fată goală pe fereastra pavilionului. Deodată observă un grup de adolescenți care îl acuză că îi spionează. Se întreabă de ce Isana și Jin trăiesc aici fără să vorbească cu nimeni. Isana le explică că este avocat pentru copaci și balene. După ce au amenințat cu represaliile, adolescenții au forțat-o pe Isan să-l lase pe Boy în casa sa, un adolescent a cărui rană a început să se estompeze, și Inago, chiar fata care i-a sugerat lui Isan să se culce cu ea. Isana merge la farmacie pentru medicamente pentru pacient, în timp ce Inago are grijă de Jin. Spre surprinderea lui Isan, fata tratează copilul cu atenție și atenție.
Unul dintre adolescenți, Takaki, îi spune lui Isana despre balenul. În copilărie, Takaki a auzit despre el, a visat despre el, dar nu l-a văzut niciodată. Numele „Arbore de balenă” îi dă lui Isan o senzație caldă, de asemenea, începe să i se pară că există un astfel de copac. Întorcându-se de la farmacie, Isana cade de pe bicicletă. Adolescenții râd, fără să creadă deloc că poate fi rănit. Isana se minunează de cruzimea lor. Takaki ajunge pentru Isana într-o mașină furată și continuă povestea Arborelui de balene. Câteva zile mai târziu, Takaki îi arată lui Isana un cache de adolescenți: s-au stabilit într-un studio de film abandonat. Au desființat-o pe schooner, pe care unul dintre ei trebuia să o păzească, în unele părți au târât-o într-un pavilion, iar acolo au strâns-o și au început să studieze afacerile maritime, pentru ca mai târziu să poată naviga. Adolescenții sunt uniți în Uniunea Marinarilor Liberi și locuiesc chiar aici, echipând cabinele din subsol.
Văzând că Takaki l-a adus pe Isan, bătălia, care aproape că și-a revenit și s-a întors la schooner, vrea să împuște „acest om nebun”: nimeni altcineva nu ar trebui să știe despre cache-ul lor. Isana nu se teme de moarte: Inago se îngrijește atât de bine de băiat, încât se poate descurca fără tată. Dar Isana trebuie să-și îndeplinească misiunea - să le spună noilor veniți din alte lumi că nu omul a domnit pe pământ, ci balenele și copacii. Lupta se teme că Isana le va raporta la poliție, dar toți ceilalți adolescenți sunt încurajați de încredere în Isan și îi oferă să i se alăture.
Un bărbat poreclit Korotky, care are deja patruzeci de ani, astfel încât este chiar mai în vârstă decât Isan, spune că la treizeci și cinci de ani a început brusc să se micșoreze și încă se micșorează. Într-adevăr, membrele lui par prea lungi în comparație cu un corp excesiv de scurt. A fost trimis la un spital de psihiatrie, dar a scăpat de acolo. Nu are loc în lumea oamenilor obișnuiți și se simte normal într-o societate de adolescenți. Ascultând raționamentul lui Isan despre copaci și balene, adolescenții ajung la concluzia că el are ceea ce le lipsește: capacitatea de a-și pune gândurile în cuvinte. Ei cred că excelenta lui poruncă a cuvântului le-ar putea fi utile.
Isana le mărturisește adolescenților păcatele ei: când era secretar al socrului său, îi aducea băieți, îngăduindu-i perversiunile. Odată ce au ucis din greșeală un băiat și, de atunci, Isana nu a cunoscut liniștea. Ca „specialist în cuvinte”, Isan începe să studieze engleza cu adolescenți, alegând pentru acest „Moby Dick” și Dostoievski într-o traducere engleză. La început, se teme că conversațiile bătrânului Zosima par prea morale pentru adolescenți, dar ascultă cu mare interes, iar cuvântul „rugăciune” îi surprinde literalmente. Spre surprinderea lui Isan, adolescenții au fost foarte iubiți de Jin și le-a plăcut să asculte muzică serioasă. Isana trăiește în așteptarea sfârșitului lumii, iar adolescenții așteaptă Marele Cutremur - au multe în comun.
Adolescenții sunt atrași de Uniunea Marinarilor Libere de către un soldat al forțelor de autoapărare - iubitul Inago. Ei vor ca el să-i învețe cum să manevreze armele. Isana îi cere soției sale Naobi să găsească un loc pe coastă unde el și prietenii săi ar putea trăi două-trei săptămâni. Naobi găsește un astfel de loc pentru ei în Izu, dar acolo Korotky comite o trădare - fotografiază exercițiile militare ale Uniunii Marinarilor Libere și vinde fotografii săptămânalului. El vrea să-i forțeze pe adolescenți să-l omoare, crezând că crima îi va uni și va transforma Uniunea Marinarilor Libere într-o organizație militară. Adolescenții aranjează un proces pentru Korotky, în timpul căruia unul dintre ei - Tamakichi - rănește accidental Korotky. Dându-și seama că rana scurtă este fatală, adolescenții decid să-l execute. Fiecare dintre ei aruncă o piatră la el. Isana și soldatul stau deoparte. Un soldat, apucând o mitralieră încărcată și aruncându-l pe Inago, se urcă pe o motocicletă și fuge, adolescenții alungă. Unul dintre ei - Tamakichi - aruncă o grenadă la o schonieră de pescuit. Sarcina se aprinde și suspiciunea cade asupra soldatului. Un soldat se sinucide. Inago devine amanta lui Isan, Isan, Dzini, Inago se întoarce la Tokyo, în refugiu. Acolo sunt întâmpinați de adolescenți: distrug un studio de film, nu aveau unde să se ducă și după ce au spart o fereastră au urcat în adăpostul lui Isan.
În pavilionul de la studioul de film nu a fost decât o singură luptă: nu a acceptat niciodată să părăsească golanul. Pentru ca ea să nu cadă în mâinile greșite, el o suflă. Muncitorii care distrug un studio de film l-au bătut pe Boy. Tamakichi îl duce pe tovarășul muribund la o clinică de la Universitatea Tokyo și îl lasă în arcadă. Adolescenții se gândesc ce să facă în continuare. Isana îi cere lui Naobi să ajute la obținerea banilor pentru ca nava să meargă la navigare cu adolescenții. Naobi s-a nominalizat la alegeri, iar Isana speră că este mai profitabil pentru ea să-și facă soțul și fiul să înoate în mare, protejând balenele, decât să stea într-un refugiu atomic. Naobi promite să ofere companiei de construcții să cumpere adăpost și terenuri de la Isan - veniturile vor fi suficiente pentru întreprinderea planificată. Doar în cazul în care adolescenții fac proviziile alimentare - dacă vor fi asediați, vor avea nevoie de ei într-un adăpost, dar dacă se așteaptă să navigheze, îi vor lua cu ei. Pentru a nu pune în pericol copilul, adolescenții îi oferă lui Isan și Jin să părăsească adăpostul, dar Isana vrea să-și informeze soția că ei și Jin sunt luați ostatic - atunci ea va pune cu siguranță o navă la dispoziție. Mașinile poliției sunt vizibile de la fereastra adăpostului. O echipă motorizată înconjura clădirea. Adolescenții trag, poliția a tras gaze lacrimogene. Ei îndeamnă pe cei asediați să se predea.
Adolescenții așteaptă sosirea soției lui Isan. Naobi ajunge, dar susține că, chiar și în numele vieții copilului ei, nu va încheia o înțelegere cu infractorii. Adolescenții luptă curajos, dar puterea nu este de partea lor și mor unul după altul. Devine clar că nu mai au nevoie de navă: încă nu au putut merge în navigare, deoarece navigatorul și operatorul radio au fost uciși. Tamakichi intenționează să lupte până la sfârșit, dar nu dorește ca Uniunea Marinarilor Libere să dispară fără urmă. El îl invită pe Takaki să plece și să-l reînvie. Isana demisionează ca specialist în conformitate cu Uniunea Marinarilor Liberi, acum se angajează pe deplin în sarcinile unui avocat de balenă și copac. Takaki recunoaște că povestea sa despre copacul balenelor este o ficțiune, dar Isana obiectează că, de îndată ce nu poate merge la casa lui Takaki și să fie convins de acest lucru, nimic nu-l împiedică să creadă că bradul balenelor există. Takaki cu un steag alb părăsește adăpostul, urmat de Inago cu Jin în brațe și un doctor (fost student la un institut medical). În timp ce merg la mașină, poliția i-a bătut.
Când mașina îi ia pe cei care s-au predat, un camion de pompieri cu o macara se ridică până la adăpost și începe să strice clădirea. Doar Isana și Tamakiti au rămas în adăpost. Isana coboară la buncăr. Punându-și picioarele pe pământ, ascultă filmul cu țipete de balene. Apa se scurge din pământ ca o fântână: emisă de un motor de incendiu, s-a scurs pe sub fundație și s-a înfundat în locul unde era o gaură în podea. Capacul gaurii se ridică, se aud fotografii. Isana trage înapoi. Apa crește din ce în ce mai mult. Revenind la sufletele copacilor și balenelor, Isana le trimite ultima iertare și moare.